Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ86

DUX4L3, Double homeobox protein 4-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L3P0CJ86 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DUX4L3P0CJ86 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUX4L3P0CJ86 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DUX4L3P0CJ86 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUX4L3P0CJ86 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms