Protein–RNA interactions for Protein: P05538

HLA-DQB2, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB2P05538 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-DQB2P05538 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DQB2P05538 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DQB2P05538 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DQB2P05538 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DQB2P05538 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DQB2P05538 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DQB2P05538 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DQB2P05538 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DQB2P05538 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DQB2P05538 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DQB2P05538 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DQB2P05538 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DQB2P05538 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DQB2P05538 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DQB2P05538 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DQB2P05538 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms