Protein–RNA interactions for Protein: P05000

IFNW1, Interferon omega-1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNW1P05000 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNW1P05000 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNW1P05000 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNW1P05000 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNW1P05000 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNW1P05000 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNW1P05000 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNW1P05000 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNW1P05000 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms