Protein–RNA interactions for Protein: P04114

APOB, Apolipoprotein B-100, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBP04114 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBP04114 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBP04114 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBP04114 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBP04114 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBP04114 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBP04114 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBP04114 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBP04114 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBP04114 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBP04114 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOBP04114 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBP04114 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBP04114 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBP04114 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBP04114 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOBP04114 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBP04114 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBP04114 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBP04114 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBP04114 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBP04114 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBP04114 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBP04114 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBP04114 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBP04114 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBP04114 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBP04114 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBP04114 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBP04114 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBP04114 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBP04114 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBP04114 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBP04114 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBP04114 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBP04114 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBP04114 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBP04114 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBP04114 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBP04114 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBP04114 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBP04114 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBP04114 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBP04114 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBP04114 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBP04114 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBP04114 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBP04114 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBP04114 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBP04114 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOBP04114 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBP04114 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBP04114 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBP04114 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBP04114 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBP04114 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBP04114 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBP04114 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBP04114 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBP04114 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBP04114 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBP04114 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBP04114 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBP04114 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBP04114 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBP04114 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBP04114 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBP04114 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBP04114 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBP04114 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBP04114 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBP04114 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBP04114 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBP04114 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
APOBP04114 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
APOBP04114 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBP04114 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBP04114 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBP04114 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBP04114 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBP04114 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBP04114 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBP04114 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBP04114 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBP04114 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBP04114 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBP04114 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBP04114 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBP04114 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBP04114 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBP04114 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBP04114 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBP04114 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBP04114 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBP04114 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBP04114 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBP04114 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBP04114 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBP04114 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBP04114 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms