Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINA1P01009 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPINA1P01009 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINA1P01009 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms