Protein–RNA interactions for Protein: O96015

DNAL4, Dynein light chain 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL4O96015 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAL4O96015 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAL4O96015 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAL4O96015 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAL4O96015 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DNAL4O96015 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DNAL4O96015 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms