Protein–RNA interactions for Protein: O95714

HERC2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, humanhuman

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Length 4,834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2O95714 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC2O95714 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC2O95714 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC2O95714 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC2O95714 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC2O95714 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC2O95714 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC2O95714 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC2O95714 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC2O95714 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC2O95714 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC2O95714 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC2O95714 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC2O95714 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC2O95714 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC2O95714 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC2O95714 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC2O95714 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC2O95714 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC2O95714 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC2O95714 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC2O95714 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC2O95714 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC2O95714 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC2O95714 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC2O95714 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC2O95714 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC2O95714 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC2O95714 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC2O95714 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HERC2O95714 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERC2O95714 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC2O95714 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC2O95714 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC2O95714 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC2O95714 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC2O95714 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC2O95714 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC2O95714 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC2O95714 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC2O95714 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC2O95714 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC2O95714 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC2O95714 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC2O95714 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC2O95714 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC2O95714 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC2O95714 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC2O95714 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC2O95714 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC2O95714 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC2O95714 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC2O95714 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC2O95714 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC2O95714 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC2O95714 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC2O95714 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC2O95714 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC2O95714 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC2O95714 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC2O95714 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC2O95714 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC2O95714 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC2O95714 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC2O95714 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC2O95714 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC2O95714 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC2O95714 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC2O95714 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC2O95714 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC2O95714 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC2O95714 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC2O95714 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC2O95714 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC2O95714 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC2O95714 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC2O95714 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC2O95714 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERC2O95714 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC2O95714 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC2O95714 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC2O95714 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC2O95714 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC2O95714 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC2O95714 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC2O95714 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC2O95714 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC2O95714 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC2O95714 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC2O95714 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC2O95714 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC2O95714 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC2O95714 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC2O95714 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC2O95714 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC2O95714 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC2O95714 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC2O95714 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC2O95714 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC2O95714 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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