Protein–RNA interactions for Protein: O94806

PRKD3, Serine/threonine-protein kinase D3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD3O94806 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PRKD3O94806 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKD3O94806 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms