Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GMDSO60547 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GMDSO60547 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GMDSO60547 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GMDSO60547 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GMDSO60547 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GMDSO60547 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GMDSO60547 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GMDSO60547 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GMDSO60547 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GMDSO60547 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GMDSO60547 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GMDSO60547 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GMDSO60547 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GMDSO60547 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GMDSO60547 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GMDSO60547 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GMDSO60547 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GMDSO60547 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GMDSO60547 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GMDSO60547 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GMDSO60547 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GMDSO60547 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GMDSO60547 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GMDSO60547 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GMDSO60547 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GMDSO60547 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GMDSO60547 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GMDSO60547 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GMDSO60547 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GMDSO60547 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GMDSO60547 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GMDSO60547 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GMDSO60547 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GMDSO60547 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GMDSO60547 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GMDSO60547 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GMDSO60547 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GMDSO60547 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GMDSO60547 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GMDSO60547 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GMDSO60547 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GMDSO60547 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GMDSO60547 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GMDSO60547 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GMDSO60547 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GMDSO60547 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GMDSO60547 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GMDSO60547 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GMDSO60547 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GMDSO60547 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GMDSO60547 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GMDSO60547 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GMDSO60547 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GMDSO60547 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GMDSO60547 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GMDSO60547 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GMDSO60547 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GMDSO60547 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GMDSO60547 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GMDSO60547 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GMDSO60547 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GMDSO60547 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GMDSO60547 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GMDSO60547 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GMDSO60547 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GMDSO60547 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GMDSO60547 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GMDSO60547 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GMDSO60547 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GMDSO60547 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GMDSO60547 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GMDSO60547 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GMDSO60547 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GMDSO60547 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GMDSO60547 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GMDSO60547 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GMDSO60547 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GMDSO60547 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GMDSO60547 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GMDSO60547 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GMDSO60547 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GMDSO60547 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GMDSO60547 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GMDSO60547 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMDSO60547 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMDSO60547 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMDSO60547 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GMDSO60547 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMDSO60547 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMDSO60547 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMDSO60547 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMDSO60547 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMDSO60547 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMDSO60547 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMDSO60547 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMDSO60547 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GMDSO60547 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMDSO60547 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMDSO60547 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms