Protein–RNA interactions for Protein: O43933

PEX1, Peroxisome biogenesis factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX1O43933 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX1O43933 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX1O43933 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX1O43933 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX1O43933 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX1O43933 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX1O43933 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX1O43933 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX1O43933 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX1O43933 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX1O43933 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX1O43933 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX1O43933 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PEX1O43933 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX1O43933 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX1O43933 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX1O43933 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX1O43933 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX1O43933 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX1O43933 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX1O43933 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX1O43933 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX1O43933 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX1O43933 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX1O43933 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX1O43933 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX1O43933 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX1O43933 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX1O43933 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX1O43933 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX1O43933 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX1O43933 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX1O43933 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX1O43933 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX1O43933 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX1O43933 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX1O43933 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX1O43933 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX1O43933 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX1O43933 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX1O43933 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX1O43933 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX1O43933 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX1O43933 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX1O43933 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX1O43933 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX1O43933 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX1O43933 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX1O43933 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX1O43933 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX1O43933 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX1O43933 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX1O43933 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX1O43933 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX1O43933 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX1O43933 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX1O43933 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX1O43933 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX1O43933 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX1O43933 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX1O43933 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX1O43933 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX1O43933 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX1O43933 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX1O43933 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX1O43933 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX1O43933 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX1O43933 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX1O43933 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX1O43933 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX1O43933 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX1O43933 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX1O43933 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX1O43933 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX1O43933 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX1O43933 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX1O43933 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX1O43933 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX1O43933 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX1O43933 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX1O43933 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX1O43933 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX1O43933 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX1O43933 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX1O43933 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX1O43933 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX1O43933 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX1O43933 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX1O43933 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX1O43933 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX1O43933 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX1O43933 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX1O43933 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX1O43933 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX1O43933 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX1O43933 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX1O43933 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX1O43933 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX1O43933 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX1O43933 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms