Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SSNA1O43805 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSNA1O43805 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSNA1O43805 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSNA1O43805 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSNA1O43805 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSNA1O43805 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSNA1O43805 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSNA1O43805 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSNA1O43805 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSNA1O43805 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSNA1O43805 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSNA1O43805 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSNA1O43805 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSNA1O43805 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSNA1O43805 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSNA1O43805 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSNA1O43805 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSNA1O43805 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSNA1O43805 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms