Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TO15178 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TO15178 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TO15178 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TO15178 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TO15178 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TO15178 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TO15178 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TO15178 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TO15178 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TO15178 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TO15178 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TO15178 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TO15178 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TO15178 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TO15178 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TO15178 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TO15178 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TO15178 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TO15178 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TO15178 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TO15178 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TO15178 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TO15178 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TO15178 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TO15178 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TO15178 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TO15178 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TO15178 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TO15178 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TO15178 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TO15178 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TO15178 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TO15178 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TO15178 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TO15178 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TO15178 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TO15178 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TO15178 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TO15178 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TO15178 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TO15178 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TO15178 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TO15178 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TO15178 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TO15178 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TO15178 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TO15178 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TO15178 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TO15178 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TO15178 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TO15178 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TO15178 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TO15178 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TO15178 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TO15178 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TO15178 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TO15178 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TO15178 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TO15178 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TO15178 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TO15178 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TO15178 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TO15178 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TO15178 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TO15178 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TO15178 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TO15178 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TO15178 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TO15178 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TO15178 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TO15178 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TO15178 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TO15178 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TO15178 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TO15178 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TO15178 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TO15178 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TO15178 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TO15178 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TO15178 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TO15178 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TO15178 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TO15178 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TO15178 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TO15178 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TO15178 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TO15178 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TO15178 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TO15178 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TO15178 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TO15178 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TO15178 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TO15178 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TO15178 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TO15178 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TO15178 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TO15178 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TO15178 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TO15178 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms