Protein–RNA interactions for Protein: O15127

SCAMP2, Secretory carrier-associated membrane protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP2O15127 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCAMP2O15127 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP2O15127 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SCAMP2O15127 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP2O15127 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP2O15127 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP2O15127 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP2O15127 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP2O15127 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP2O15127 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP2O15127 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP2O15127 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP2O15127 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms