Protein–RNA interactions for Protein: O15020

SPTBN2, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN2O15020 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTBN2O15020 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTBN2O15020 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTBN2O15020 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTBN2O15020 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTBN2O15020 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTBN2O15020 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTBN2O15020 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTBN2O15020 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTBN2O15020 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTBN2O15020 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTBN2O15020 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTBN2O15020 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTBN2O15020 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTBN2O15020 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTBN2O15020 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTBN2O15020 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTBN2O15020 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTBN2O15020 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTBN2O15020 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPTBN2O15020 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTBN2O15020 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTBN2O15020 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTBN2O15020 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTBN2O15020 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTBN2O15020 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTBN2O15020 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTBN2O15020 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTBN2O15020 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTBN2O15020 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBN2O15020 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBN2O15020 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBN2O15020 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBN2O15020 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBN2O15020 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTBN2O15020 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTBN2O15020 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms