Protein–RNA interactions for Protein: O14910

LIN7A, Protein lin-7 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7AO14910 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LIN7AO14910 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LIN7AO14910 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIN7AO14910 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms