Protein–RNA interactions for Protein: O00574

CXCR6, C-X-C chemokine receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR6O00574 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCR6O00574 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR6O00574 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms