Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NFKBIEO00221 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NFKBIEO00221 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NFKBIEO00221 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NFKBIEO00221 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NFKBIEO00221 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NFKBIEO00221 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NFKBIEO00221 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NFKBIEO00221 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NFKBIEO00221 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NFKBIEO00221 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NFKBIEO00221 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NFKBIEO00221 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NFKBIEO00221 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NFKBIEO00221 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NFKBIEO00221 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NFKBIEO00221 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
NFKBIEO00221 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NFKBIEO00221 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NFKBIEO00221 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NFKBIEO00221 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NFKBIEO00221 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NFKBIEO00221 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NFKBIEO00221 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NFKBIEO00221 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NFKBIEO00221 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NFKBIEO00221 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NFKBIEO00221 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NFKBIEO00221 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NFKBIEO00221 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NFKBIEO00221 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NFKBIEO00221 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NFKBIEO00221 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NFKBIEO00221 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NFKBIEO00221 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NFKBIEO00221 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NFKBIEO00221 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NFKBIEO00221 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NFKBIEO00221 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NFKBIEO00221 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NFKBIEO00221 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFKBIEO00221 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFKBIEO00221 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFKBIEO00221 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFKBIEO00221 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFKBIEO00221 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFKBIEO00221 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NFKBIEO00221 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NFKBIEO00221 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NFKBIEO00221 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NFKBIEO00221 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NFKBIEO00221 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NFKBIEO00221 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms