Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3KRW8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3KRW8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3KRW8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3KRW8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3KRW8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3KRW8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3KRW8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3KRW8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3KRW8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3KRW8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3KRW8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3KRW8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3KRW8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3KRW8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3KRW8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3KRW8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3KRW8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3KRW8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3KRW8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3KRW8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3KRW8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3KRW8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3KRW8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3KRW8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3KRW8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3KRW8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
J3KRW8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3KRW8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3KRW8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
J3KRW8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3KRW8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3KRW8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3KRW8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3KRW8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3KRW8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3KRW8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3KRW8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
J3KRW8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
J3KRW8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
J3KRW8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3KRW8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3KRW8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3KRW8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3KRW8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3KRW8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3KRW8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3KRW8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3KRW8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3KRW8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3KRW8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3KRW8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3KRW8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3KRW8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3KRW8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3KRW8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3KRW8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3KRW8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3KRW8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
J3KRW8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3KRW8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
J3KRW8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
J3KRW8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3KRW8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3KRW8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3KRW8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3KRW8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3KRW8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3KRW8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3KRW8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3KRW8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3KRW8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3KRW8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3KRW8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3KRW8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3KRW8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3KRW8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3KRW8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3KRW8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3KRW8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3KRW8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3KRW8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3KRW8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3KRW8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3KRW8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3KRW8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3KRW8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3KRW8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3KRW8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3KRW8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3KRW8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3KRW8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3KRW8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3KRW8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3KRW8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
J3KRW8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
J3KRW8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3KRW8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3KRW8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3KRW8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms