Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
I3L3M4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
I3L3M4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
I3L3M4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
I3L3M4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
I3L3M4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
I3L3M4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
I3L3M4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
I3L3M4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
I3L3M4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
I3L3M4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
I3L3M4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
I3L3M4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
I3L3M4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
I3L3M4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
I3L3M4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
I3L3M4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
I3L3M4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
I3L3M4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
I3L3M4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
I3L3M4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
I3L3M4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
I3L3M4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
I3L3M4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
I3L3M4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
I3L3M4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
I3L3M4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
I3L3M4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
I3L3M4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
I3L3M4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
I3L3M4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
I3L3M4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
I3L3M4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
I3L3M4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
I3L3M4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
I3L3M4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
I3L3M4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
I3L3M4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
I3L3M4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
I3L3M4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
I3L3M4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
I3L3M4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
I3L3M4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
I3L3M4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
I3L3M4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
I3L3M4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
I3L3M4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
I3L3M4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
I3L3M4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
I3L3M4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
I3L3M4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
I3L3M4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
I3L3M4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
I3L3M4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
I3L3M4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
I3L3M4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
I3L3M4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
I3L3M4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
I3L3M4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
I3L3M4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
I3L3M4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
I3L3M4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
I3L3M4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
I3L3M4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
I3L3M4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
I3L3M4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
I3L3M4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
I3L3M4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
I3L3M4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
I3L3M4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
I3L3M4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
I3L3M4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
I3L3M4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
I3L3M4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
I3L3M4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
I3L3M4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
I3L3M4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
I3L3M4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
I3L3M4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
I3L3M4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
I3L3M4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
I3L3M4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
I3L3M4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
I3L3M4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
I3L3M4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
I3L3M4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
I3L3M4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
I3L3M4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
I3L3M4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
I3L3M4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
I3L3M4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
I3L3M4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
I3L3M4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
I3L3M4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
I3L3M4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
I3L3M4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
I3L3M4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
I3L3M4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
I3L3M4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
I3L3M4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms