Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CROCC2H7BZ55 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CROCC2H7BZ55 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CROCC2H7BZ55 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CROCC2H7BZ55 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CROCC2H7BZ55 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CROCC2H7BZ55 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CROCC2H7BZ55 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CROCC2H7BZ55 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CROCC2H7BZ55 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CROCC2H7BZ55 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CROCC2H7BZ55 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
CROCC2H7BZ55 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CROCC2H7BZ55 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CROCC2H7BZ55 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CROCC2H7BZ55 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CROCC2H7BZ55 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CROCC2H7BZ55 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CROCC2H7BZ55 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CROCC2H7BZ55 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CROCC2H7BZ55 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CROCC2H7BZ55 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CROCC2H7BZ55 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CROCC2H7BZ55 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CROCC2H7BZ55 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
CROCC2H7BZ55 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CROCC2H7BZ55 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CROCC2H7BZ55 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CROCC2H7BZ55 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CROCC2H7BZ55 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CROCC2H7BZ55 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CROCC2H7BZ55 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CROCC2H7BZ55 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CROCC2H7BZ55 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CROCC2H7BZ55 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CROCC2H7BZ55 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CROCC2H7BZ55 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CROCC2H7BZ55 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CROCC2H7BZ55 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CROCC2H7BZ55 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CROCC2H7BZ55 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CROCC2H7BZ55 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CROCC2H7BZ55 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CROCC2H7BZ55 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CROCC2H7BZ55 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
CROCC2H7BZ55 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CROCC2H7BZ55 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CROCC2H7BZ55 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CROCC2H7BZ55 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CROCC2H7BZ55 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CROCC2H7BZ55 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CROCC2H7BZ55 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CROCC2H7BZ55 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CROCC2H7BZ55 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CROCC2H7BZ55 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CROCC2H7BZ55 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CROCC2H7BZ55 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CROCC2H7BZ55 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CROCC2H7BZ55 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CROCC2H7BZ55 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
CROCC2H7BZ55 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CROCC2H7BZ55 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
CROCC2H7BZ55 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CROCC2H7BZ55 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CROCC2H7BZ55 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CROCC2H7BZ55 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CROCC2H7BZ55 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CROCC2H7BZ55 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CROCC2H7BZ55 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CROCC2H7BZ55 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CROCC2H7BZ55 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms