Protein–RNA interactions for Protein: E5RHQ5

NPIPB11, Nuclear pore complex-interacting protein family member B11, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB11E5RHQ5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPB11E5RHQ5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPIPB11E5RHQ5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPIPB11E5RHQ5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NPIPB11E5RHQ5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPIPB11E5RHQ5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPIPB11E5RHQ5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPIPB11E5RHQ5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPIPB11E5RHQ5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms