Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DIRC3C9JPN6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DIRC3C9JPN6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DIRC3C9JPN6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DIRC3C9JPN6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DIRC3C9JPN6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DIRC3C9JPN6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DIRC3C9JPN6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DIRC3C9JPN6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DIRC3C9JPN6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DIRC3C9JPN6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms