Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IQCJ-SCHIP1C9J366 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IQCJ-SCHIP1C9J366 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IQCJ-SCHIP1C9J366 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IQCJ-SCHIP1C9J366 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IQCJ-SCHIP1C9J366 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IQCJ-SCHIP1C9J366 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IQCJ-SCHIP1C9J366 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IQCJ-SCHIP1C9J366 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IQCJ-SCHIP1C9J366 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IQCJ-SCHIP1C9J366 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IQCJ-SCHIP1C9J366 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IQCJ-SCHIP1C9J366 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IQCJ-SCHIP1C9J366 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IQCJ-SCHIP1C9J366 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IQCJ-SCHIP1C9J366 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms