Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf172C9J069 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf172C9J069 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9orf172C9J069 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms