Protein–RNA interactions for Protein: B1APH4

ZNF487, Putative zinc finger protein 487, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF487B1APH4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF487B1APH4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF487B1APH4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms