Protein–RNA interactions for Protein: A8MXY4

ZNF99, Zinc finger protein 99, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF99A8MXY4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF99A8MXY4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF99A8MXY4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF99A8MXY4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF99A8MXY4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF99A8MXY4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF99A8MXY4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF99A8MXY4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF99A8MXY4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF99A8MXY4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF99A8MXY4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF99A8MXY4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF99A8MXY4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF99A8MXY4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF99A8MXY4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF99A8MXY4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms