Protein–RNA interactions for Protein: A6NM11

LRRC37A2, Leucine-rich repeat-containing protein 37A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC37A2A6NM11 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC37A2A6NM11 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC37A2A6NM11 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRC37A2A6NM11 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC37A2A6NM11 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC37A2A6NM11 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC37A2A6NM11 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC37A2A6NM11 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms