Protein–RNA interactions for Protein: A6NI56

CCDC154, Coiled-coil domain-containing protein 154, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC154A6NI56 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC154A6NI56 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC154A6NI56 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC154A6NI56 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC154A6NI56 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC154A6NI56 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC154A6NI56 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC154A6NI56 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC154A6NI56 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC154A6NI56 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC154A6NI56 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC154A6NI56 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC154A6NI56 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC154A6NI56 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC154A6NI56 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC154A6NI56 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC154A6NI56 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC154A6NI56 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms