Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERINC4A6NH21 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SERINC4A6NH21 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERINC4A6NH21 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms