Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HELTA6NFD8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HELTA6NFD8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HELTA6NFD8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HELTA6NFD8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HELTA6NFD8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HELTA6NFD8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HELTA6NFD8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HELTA6NFD8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HELTA6NFD8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HELTA6NFD8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HELTA6NFD8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HELTA6NFD8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HELTA6NFD8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HELTA6NFD8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HELTA6NFD8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HELTA6NFD8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HELTA6NFD8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HELTA6NFD8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HELTA6NFD8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
HELTA6NFD8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HELTA6NFD8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HELTA6NFD8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms