Protein–RNA interactions for Protein: A0PK05

TMEM72, Transmembrane protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM72A0PK05 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM72A0PK05 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms