Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNSTRNQ9Y448 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms