Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPR55Q9Y2T6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms