Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms