Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms