Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DTX4Q9Y2E6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DTX4Q9Y2E6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms