Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCE1Q9Y256 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms