Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX6Q9UNH7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX6Q9UNH7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms