Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX7Q9UNH6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms