Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN11AQ9UI33 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms