Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTNNAL1Q9UBT7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNAL1Q9UBT7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms