Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHPF2Q9P2E5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms