Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC88CQ9P219 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms