Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHRF1Q9P1Y6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms