Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms