Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM7SF3Q9NS93 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms