Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms