Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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