Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM27Q9HBJ8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms