Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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